非典型苯丙酮尿症是由于鸟苷三磷酸环化水合酶(GTP-CH),6-丙酮酰四氢蝶呤合成酶(6-PTS),二氢生物蝶呤还原酶(DHPR),和四氢生物蝶呤(BH4)中任何一种物质的缺乏导致,苯丙氨酸羟化酶的缺乏造成典型型苯丙酮尿症。
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